Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc12a1P55014 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc12a1P55014 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms