Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Faf1P54731 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Faf1P54731 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Faf1P54731 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Faf1P54731 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms