Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms