Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cacnb3P54285 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cacnb3P54285 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cacnb3P54285 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cacnb3P54285 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cacnb3P54285 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacnb3P54285 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacnb3P54285 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacnb3P54285 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacnb3P54285 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacnb3P54285 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacnb3P54285 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacnb3P54285 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacnb3P54285 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacnb3P54285 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacnb3P54285 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacnb3P54285 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacnb3P54285 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms