Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PctpP53808 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PctpP53808 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PctpP53808 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PctpP53808 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms