Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Map3k1P53349 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms