Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Lbx1P52955 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Lbx1P52955 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Lbx1P52955 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lbx1P52955 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Lbx1P52955 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Lbx1P52955 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Lbx1P52955 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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