Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox5P52651 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms