Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp1P52624 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms