Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e3P52483 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms