Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ClgnP52194 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms