Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CcnfP51944 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnfP51944 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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