Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms