Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RoraP51448 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RoraP51448 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RoraP51448 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RoraP51448 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RoraP51448 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RoraP51448 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RoraP51448 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RoraP51448 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RoraP51448 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RoraP51448 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RoraP51448 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RoraP51448 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RoraP51448 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RoraP51448 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RoraP51448 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RoraP51448 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RoraP51448 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RoraP51448 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RoraP51448 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RoraP51448 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RoraP51448 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RoraP51448 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RoraP51448 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RoraP51448 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RoraP51448 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RoraP51448 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RoraP51448 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RoraP51448 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RoraP51448 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RoraP51448 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RoraP51448 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RoraP51448 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RoraP51448 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RoraP51448 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RoraP51448 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RoraP51448 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RoraP51448 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RoraP51448 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RoraP51448 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RoraP51448 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RoraP51448 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RoraP51448 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RoraP51448 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RoraP51448 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RoraP51448 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RoraP51448 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RoraP51448 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RoraP51448 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RoraP51448 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RoraP51448 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RoraP51448 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RoraP51448 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RoraP51448 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RoraP51448 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms