Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TspoP50637 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TspoP50637 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TspoP50637 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TspoP50637 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TspoP50637 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TspoP50637 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TspoP50637 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TspoP50637 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TspoP50637 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TspoP50637 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TspoP50637 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TspoP50637 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TspoP50637 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TspoP50637 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TspoP50637 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TspoP50637 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TspoP50637 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TspoP50637 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TspoP50637 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TspoP50637 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TspoP50637 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TspoP50637 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TspoP50637 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TspoP50637 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms