Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SftpdP50404 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms