Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc13P50207 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms