Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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BckdhaP50136 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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BckdhaP50136 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdhaP50136 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms