Protein–RNA interactions for Protein: P49660

Sstr4, Somatostatin receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr4P49660 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sstr4P49660 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms