Protein–RNA interactions for Protein: P49452

Cenpc, Centromere protein C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpcP49452 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CenpcP49452 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpcP49452 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpcP49452 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpcP49452 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpcP49452 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms