Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms