Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox8bP48772 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms