Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms