Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CratP47934 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CratP47934 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CratP47934 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CratP47934 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CratP47934 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CratP47934 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CratP47934 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CratP47934 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CratP47934 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CratP47934 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CratP47934 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CratP47934 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CratP47934 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CratP47934 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CratP47934 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CratP47934 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CratP47934 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CratP47934 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CratP47934 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CratP47934 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CratP47934 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CratP47934 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CratP47934 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CratP47934 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CratP47934 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CratP47934 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms