Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rph3aP47708 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms