Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgavP43406 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgavP43406 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgavP43406 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgavP43406 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgavP43406 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms