Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms