Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Elk1P41969 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Elk1P41969 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elk1P41969 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elk1P41969 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Elk1P41969 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elk1P41969 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elk1P41969 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elk1P41969 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elk1P41969 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elk1P41969 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elk1P41969 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elk1P41969 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elk1P41969 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk1P41969 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Elk1P41969 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Elk1P41969 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Elk1P41969 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Elk1P41969 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Elk1P41969 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Elk1P41969 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Elk1P41969 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Elk1P41969 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Elk1P41969 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elk1P41969 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elk1P41969 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elk1P41969 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elk1P41969 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Elk1P41969 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elk1P41969 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elk1P41969 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elk1P41969 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elk1P41969 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Elk1P41969 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk1P41969 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elk1P41969 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elk1P41969 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elk1P41969 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elk1P41969 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elk1P41969 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Elk1P41969 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elk1P41969 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elk1P41969 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elk1P41969 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elk1P41969 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elk1P41969 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Elk1P41969 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elk1P41969 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Elk1P41969 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elk1P41969 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elk1P41969 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elk1P41969 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms