Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms