Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt4P40749 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt4P40749 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms