Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VhlP40338 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VhlP40338 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VhlP40338 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VhlP40338 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VhlP40338 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VhlP40338 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VhlP40338 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VhlP40338 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VhlP40338 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VhlP40338 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VhlP40338 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VhlP40338 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VhlP40338 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VhlP40338 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VhlP40338 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VhlP40338 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VhlP40338 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VhlP40338 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VhlP40338 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VhlP40338 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VhlP40338 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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