Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ThpoP40226 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ThpoP40226 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ThpoP40226 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms