Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd1P40201 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd1P40201 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chd1P40201 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd1P40201 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd1P40201 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd1P40201 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd1P40201 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms