Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms