Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf1P39428 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf1P39428 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf1P39428 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf1P39428 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf1P39428 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf1P39428 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms