Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik2P39087 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik2P39087 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik2P39087 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik2P39087 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik2P39087 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms