Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TtlP38585 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtlP38585 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtlP38585 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtlP38585 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtlP38585 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtlP38585 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtlP38585 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtlP38585 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtlP38585 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtlP38585 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtlP38585 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtlP38585 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtlP38585 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtlP38585 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtlP38585 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtlP38585 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtlP38585 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TtlP38585 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TtlP38585 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TtlP38585 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TtlP38585 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TtlP38585 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TtlP38585 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TtlP38585 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtlP38585 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtlP38585 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtlP38585 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtlP38585 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtlP38585 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtlP38585 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtlP38585 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtlP38585 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtlP38585 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtlP38585 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtlP38585 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TtlP38585 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtlP38585 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtlP38585 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtlP38585 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtlP38585 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtlP38585 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtlP38585 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtlP38585 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtlP38585 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtlP38585 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtlP38585 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtlP38585 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtlP38585 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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