Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms