Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab17P35292 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab17P35292 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab17P35292 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab17P35292 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms