Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab23P35288 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab23P35288 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab23P35288 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms