Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sftpa1P35242 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sftpa1P35242 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sftpa1P35242 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sftpa1P35242 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms