Protein–RNA interactions for Protein: P34968

Htr2c, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr2cP34968 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr2cP34968 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr2cP34968 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms