Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptk2P34152 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms