Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc11P31313 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc11P31313 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms