Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms