Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc10P31257 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms