Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd28P31041 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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