Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnnd1P30999 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnd1P30999 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms