Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms