Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms